In diesen Jahren kam es schließlich zum Bürgerkrieg auf Hispaniola. Die Mulatten, unter Führung von Rigaud, unterlagen den Franzosen, die wiederum von Toussaint L'Ouverture geführt wurden. Toussaint L'Ouverture selbst ein Nachkomme der importierten Sklaven nahm nun 1801 Santo Domingo ein. Am 27. August des selben Jahres war er es dann auch der die Abschaffung der Sklaverei durchsetzte.